获得已知的基因序列或已知的氨基酸序列，可以根据氨基酸之间的共价键和修饰基团，通过软件构建出该蛋白的3D结构模型，进而预测该蛋白可能与未知蛋白存在相互作用或药物作用位点。

通过模拟获得的蛋白三维结构模型

已知蛋白的基因序列

蛋白三维结构模型​